O álbum foi antecipado por Brussels Is Haunted, The Light That Surrounds You e, mais recentemente, Take Me By The Hand, lançado a 4 de setembro. Este último abre o disco e foi produzido por Ian McCulloch, com mistura de Alan Moulder e Andrea Wright.
Há ainda um elemento importante na história de Apples for Isaac: o falecido baterista dos Blondie Clem Burke toca em 10 das 11 faixas. Burke morreu durante o período de conclusão do álbum, e os próprios Echo & The Bunnymen salientaram que o músico foi uma parte fundamental da sua gravação.
Musicalmente, o álbum mantém Ian McCulloch e Will Sergeant no centro de uma linguagem construída a partir do post-punk, guitarras atmosféricas e melodias sombrias que marcaram a identidade dos Echo & The Bunnymen desde o final dos anos 70.
